沃克维尔小学的孩子们回来了，这回他们有了个新的科学老师！菲奥娜·福瑞斯是原来那个福瑞斯老师的妹妹，她同样十分古灵精怪、富有创造力、幽默风趣。神奇校巴带着同学们踏上历险，探索科学的奥妙。阿诺德亲身体验到一个不受控制的植物会如何轻易破坏生态系统。在前往夏威夷的旅途中，旺达通过鱼的眼睛看世界并学会如何像鱼一样游动。拉尔夫和伙伴们变成亚原子形态，他们使用磁力援救被困的校巴。卡洛斯无法停止打喷嚏，同学们近距离观察是什么造成了他的状况。对同学们来说连外太空都不算太远：凯莎因按了一个按钮不小心给宇宙带来了混乱。
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